Sundhedsstyrelsen gennemfører i år 2010 og 2011 en evaluering af sundhedsaftalerne, der skal følge op på de første års erfaringer og skabe et bedre grundlag for at sprede de gode løsninger og følge op på sundhedsaftalerne.

Første delrapport i evalueringen af sundhedsaftalerne udkom i september 2010, og nu er anden delrapport i evalueringen færdig.

I forlængelse af arbejdet med at udvikle indikatorer, afholder Sundhedsstyrelsen ved udgangen af 2011 en national konference om sundhedsaftalerne.