Kommunalbestyrelserne fastlægger lægekonsulenternes arbejdsopgaver. Det har Folketingets Ombudsmand slået fast i en ny afgørelse.

Det betyder, at Social- og Integrationsministeriet ikke kan fastsætte retligt bindende retningslinjer for, hvilke arbejdsopgaver kommunale lægekonsulenter må beskæftige sig med. Kommunalbestyrelsen har instruktionsbeføjelse over for lægekonsulenterne på samme måde som for andet kommunalt ansat administrativt personale.

10. april 2012 vedtog Folketinget et forslag til vedtagelse om anvendelse af lægekonsulenter. Heri konstaterer Folketinget blandt andet, at de verserende forhandlinger om en reform af førtidspension og fleksjob kan berøre problemstillingen om lægekonsulenternes rolle og funktion.